ciao, sono uno scarsissimo fruitore di QGIS.
Io ho risolto inserendo 0 in Proprietà > Trasparenza > Nessun valore
lo 0 per me è il bianco e così diventa Trasparente in tutte le sovrapposizioni.
Spero di esserti stato utile, nella mia pochezza !!!
Riccardo Giaccari